Depende da bolsa. Existem bolsas institucionais, pagas pelas agências de fomento à pesquisa, mas administradas pelos programas de pós-graduação e, por isso, os critérios de seleção e concessão destas bolsas institucionais são definidos pelo próprio programa. Algumas bolsas são obtidas pelos orientadores por meio de projetos de pesquisa; nesse caso o gerenciamento da bolsa é prerrogativa do professor. Por fim, algumas bolsas são concedidas diretamente aos alunos por meio de editais e processo seletivo na agência de fomento.